21世紀世界風云的主題是和平與發展。然而，面對國際局勢復雜多變，全球經濟一體化及企業經營國際化的激烈競爭，我國各領域的挑戰正日益增加。為應對各種傳統安全和非傳統安全的威脅，以及經濟迅速發展的需要，上海交通大學國家戰略研究中心于2005年9月12日成立，主要針對我國國家戰略領域的重大問題和政策開展研究并進行交流和合作，其宗旨是成為我國有影響的思想庫，充分發揮上海交通大學等高等院校人才智庫，依托上海市太平洋區域經濟發展研究會這個聯系平臺，開展對外學術交流，加強對我國國家戰略、政治和經濟發展戰略的研究，為黨、政府及企業的戰略決策提供咨詢、人才培養和服務。
上海交通大學國家戰略研究中心是外向型的學術研究及培訓機構，對外交流廣泛，與美國、英國、德國、法國、俄羅斯、韓國、日本等國和我國臺灣地區的國際問題學者、機構及國際著名智庫等都有著廣泛的交流和密切的合作，共同對國際熱點問題展開了客觀的、深入的學術互動和探討。為此，中心自成立以來，已產生了一大批有質量的研究報告。為我國經濟發展的決策起到了一定的促進作用。
上海交通大學國家戰略研究中心與世界著名智庫——美國蘭德公司有著戰略合作關系。在本中心成立之日就與蘭德公司簽訂了長期合作意向書，結成戰略伙伴。幾年來，共同合作舉辦過多次大型的論壇和國際學術研討會，其中, 與上海太平洋區域經濟發展研究會三家共同舉辦的每年一度的大型“太平洋論壇”，在國內外更是享有盛譽。
此外，上海交通大學國家戰略研究中心在人才培養、學術及文化交流方面還與許多國際著名高校、基金會及研究機構等建立了密切的合作關系：如：中國人民解放軍軍事科學院、中國社會科學院、聯合國經社理事會、美國哈佛大學、美國哥倫比亞大學、 美國喬治城大學、英國威爾士大學、國家外國專家局國際人才交流協會、美中關系全國委員會等。